Το Περιφερειακό Επιχειρησιακό Πρόγραμμα (ΠΕΠ) Κρήτης 2000-2006 είναι ένα από τα 24 Προγράμματα του Γ' Κοινοτικού Πλαισίου Στήριξης 2000-2006 για την Ελλάδα και συγχρηματοδοτείται από τα Διαρθρωτικά Ταμεία της Ευρωπαϊκής Ένωσης :

• Ευρωπαϊκό Ταμείο Περιφερειακής Ανάπτυξης (ΕΤΠΑ)
• Ευρωπαϊκό Κοινωνικό Ταμείο (ΕΚΤ)
• Ευρωπαϊκό Ταμείο Προσανατολισμού και Εγγυήσεων (ΕΓΤΠΕ)

Στο πλαίσιο διαχείρισης, παρακολούθησης και ελέγχου του ΠΕΠ Κρήτης σύμφωνα το Νόμο 2860/2000 (ΦΕΚ 251/τ.Α'/14-11-2000) συστήθηκε στην Περιφέρεια Κρήτης, η Υπηρεσία Διαχείρισης του Επιχειρησιακού Προγράμματος Κρήτης που υπάγεται απευθείας στον Γενικό Γραμματέα της Περιφέρειας Κρήτης. Σκοπός της Υπηρεσίας είναι η άσκηση των αρμοδιοτήτων που αναφέρονται στο Άρθρο 4 του Ν.2860/2000 και συγκεκριμένα, είναι αρμόδια για να εξασφαλίσει την αποτελεσματικότητα και την κανονικότητα της διαχείρισης και της εφαρμογής του ΠΕΠ Κρήτης 2000-2006.

Η ιστοσελίδα του ΠΕΠ Κρήτης περιέχει πληροφορίες σχετικά με το Πρόγραμμα, το Συμπλήρωμα Προγραμματισμού, τις Προσκλήσεις Υποβολής των Προτάσεων για ένταξη στο πρόγραμμα ενώ παράλληλα δίνει πληροφορίες για την πορεία υλοποίησης του προγράμματος , τις διαδικασίες υλοποίησης και τα αποτελέσματα του.